Paragon Genomics是一家位于美國硅谷的生命科技初創公司。我們致力于開發具有突破性且易于使用的超高多重PCR技術, 用于基因組分析和臨床診斷市場。我們的核心技術將首先應用于下一代基因測序文庫制備市場,從而實現更準確, 更快, 并且更便宜的DNA測序樣品制備和個體化醫療。
基因檢測是整個精準醫學的基礎,來自美國硅谷的Paragon Genomics正是一家致力于突破目前基因檢測領域靶向測序準確度及覆蓋率低、成本高及時間長等瓶頸的生命科技公司。
公司開發的超高多重PCR生物試劑平臺技術CleanPlex,能使得二代測序靶向基因文庫制備的速度比市場上現有方法快5-10倍,并且更加靈敏和準確。
CleanPlex的另外一個明顯優勢是其所需的樣本量只有1-10納克, 對于一些DNA量本身就少的樣本(比如細針穿刺活檢樣本、液態活檢樣本等)尤為重要。而現有技術一般至少需要高達50 ng的DNA樣本。
據介紹,CleanPlex技術主要由三個部分組成:超高且均一的多重PCR試劑系統,快速高效的PCR背景清除技術,和高度精確且可擴展的NGS面板設計軟件。多重PCR試劑系統確保多達4000 個DNA片段可以在同一個PCR反應管中被均勻地擴增。
PCR背景清除技術可以有效并迅速地去除非特異性PCR產物。NGS面板設計軟件能夠為客戶設計并優化得到高效率、高專一性和高均一性的靶向測序面板。
下面是CleanPlex ?針對Illumina測序儀的一個典型的工作流程:
下面是一個由CleanPlex制備,包含4000個PCR反應的DNA文庫在Bioanalyzer上的DNA片段質檢圖。標記35和10380上的峰為參照DNA。圖中可以看出經過CleanPlex制備的文庫非常干凈,背景噪音非常小。這對于檢測低頻變異體(特別是液態活檢方面的應用)具有獨特優勢。
基于CleanPlex, Paragon Genomics已經開發出一整套二代測序靶向基因文庫制備解決方案及產品。CleanPlex文庫制備試劑盒與其獨特設計的引物面板(定制或者目錄面板)共同使用時,具有快速簡便、高均一性、高覆蓋率等特點。因為CleanPlex使用的引物無需做任何化學修飾,其合成成本也可以比其他方法低4-6倍。下面是CleanPlex的主要特點。
3小時簡易工作流程 (包括僅30分鐘的簡易手工操作);
高均一性 (>98%)、高上靶率 (>98%)、低背景噪音等特點極大提高變異體(包括低頻變異體)的正確檢出率;
可擴增極難擴增的區域(比如癌癥中常見的TERT Promoter突變區域);
低樣本要求量 (1 – 10 ng), 在樣本量少的情況下尤為重要;
與Illumina?測序平臺兼容;
適用于gDNA、FFPE DNA、新鮮冰凍及血漿游離DNA等不同類型樣品;
PCR引物無需化學修飾;
超高多重PCR擴展性:單管20 - 4000重PCR反應。
Paragon Genomics有兩位創始人,皆是在生命科學產業界具有多年技術及商務經驗的留美華人。諶濤,公司聯合創始人,現任公司CEO,哈佛商學院工商管理碩士,北京大學化學本科。
擁有15年生命科學行業的研發、管理和商務經驗;之前受雇于在生物儀器及試劑行業全球排名第一的公司ThermoFisher/LifeTechnologies,擔任過企業戰略及發展、公司并購等部門的領導職位,并且管理過一億美金的PCR生物試劑業務,同時擁有5年在輝瑞制藥的藥物研發經驗。
劉至東是公司另一位聯合創始人,公司核心技術CleanPlex的發明者,現任公司總裁兼CTO,洛克菲勒大學博士后,南卡羅來納大學分子遺傳學博士,中科院碩士,武漢大學病毒學本科。擁有超過20年的基因測序、分子診斷、基因文庫制備技術經驗,之前受雇于Thermo Fisher / Life Technologies和西門子醫療,主導生命科學試劑的研發、制造和質量控制。
公司于2015年10月成功完成種子輪融資,近期公司還成功被選入美國加州生命科學協會( CLSI)2016年春季全明星創業團隊項目。目前已擁有斯坦福大學、美國加州大學舊金山分校及數家大型第三方檢驗實驗室等重量級客戶。
今年七月份公司正式發布其二代測序文庫制備試劑盒、面板設計服務和一個基于CleanPlex的熱點癌癥面板。公司希望憑借CleanPlex及強大的靶向測序面板設計能力,成為精準醫療領域的“安卓”,為科研機構、第三方檢驗所及廣大NGS應用開發商提供定制或通用的靶向測序面板及應用系統,共同開發千億級的無創產前診斷及篩查、癌癥診斷、液態活檢、遺傳病檢測及個體化用藥指導等廣闊市場。
貨號 | 產品種類 | 產品名稱(英文原名/中文名稱) | 包裝 |
816001 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit | 8 |
816002 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit | 96 |
816003 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit | 384 |
816006 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit, for 2-pool panels | 8 |
816007 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit, for 2-pool panels | 96 |
816008 | 測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Targeted Library Kit, for 2-pool panels | 384 |
916001 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Generic Cancer Panel | 8 |
916002 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Generic Cancer Panel | 96 |
916003 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? Generic Cancer Panel | 384 |
916005 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? BRCA1 & BRCA2 Panel | 8 |
916006 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? BRCA1 & BRCA2 Panel | 96 |
916007 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? BRCA1 & BRCA2 Panel | 384 |
916008 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? TP53 Panel | 8 |
916009 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? TP53 Panel | 96 |
916010 | 引物面板和配套測序文庫制備試劑盒 | CleanPlex? TP53 Panel | 384 |
716003 | 條形碼標記引物 | CleanPlex? Single-Indexed PCR Primers for Illumina? | 24 |
716004 | 條形碼標記引物 | CleanPlex? Single-Indexed PCR Primers for Illumina? | 96 |
716005 | 條形碼標記引物 | CleanPlex? Dual-Indexed PCR Primers for Illumina? | 24 |
716006 | 條形碼標記引物 | CleanPlex? Dual-Indexed PCR Primers for Illumina? | 96 |
616001 | 服務 | Custom Panel Design Service, 7-100 amplicons | N/A |
616002 | 服務 | Custom Panel Design Service, 101-500 amplicons | N/A |
616003 | 服務 | Custom Panel Design Service, 501-1000 amplicons | N/A |
616004 | 服務 | Custom Panel Design Service, 1001-5000 amplicons | N/A |
616005 | 服務 | Custom Panel Design Service, 5001-10000 amplicons | N/A |
技術支持:易動力網絡